Unutrašnja organizacija
U Zavodu prema važećoj sistematizaciji postoje sledeće organizacione jedinice:
- Centar za promociju zdravlja
- Centar za analizu, planiranje, organizaciju zdravstvene zaštite i informatiku sa biostatistikom u zdravstvu
- Odeljenje za analizu, planiranje i organizaciju zdravstvene zaštite;
- Odeljenje za biostatistiku i informatiku u zdravstvu;
- Centar za kontrolu i prevenciju bolesti
- Odsek za opštu epidemiologiju i hronične nezarazne bolesti;
- Odsek za imunizaciju i respiratorne zarazne bolesti;
- Odsek za bolničke infekcije, polno prensive i ostale zarazne bolesti;
- Odsek za zdravstveni nadzor i crevne zarazne bolesti;
- Odsek za DDD poslove, zoonoze i transmisivne zarazne bolesti
- Centar za higijenu i humanu ekologiju
- Odeljenje za uzorkovanje, prijem uzoraka i monitoring;
- Odsek za higijenu i humanu ekologiju;
- Odsek za pravilnu ishranu, zdravstvenu bezbednost hrane i školsku higijenu;
- Odeljenje za ekotoksikologiju;
- Odeljenje za sanitarnu hemiju i instrumentalna ispitivanja;
- Centar za mikrobiologiju
- Odeljenje za prijem materijala, virusologiju i serologiju;
- Odsek za urnokulture i genitalne sekrete;
- Odsek za briseve i piokulture;
- Odeljenje za koprokulture, parazitologiju i mikologiju;
- Odeljenje za sanitarnu mikrobiologiju;
- Služba za pravne, ekonomsko-finansijske, tehničke i druge slične poslove
- Odeljenje za ekonomsko – finansijske i računovodstvene poslove;
- Odeljenje za pravne, opšte i tehničke poslove